目前我国比较权威的论文查重检测系统有知网、维普、万方。万方不能检测互联网的资源，而且收录的文献资源较少，维普适合在写作时不断修改检查时使用，知网检测比较准确,其中中国知网PMLC系统（大学生论文抄袭检测系统）拥有正规版权的期刊、海量的比对数据库,能实现基于内容的信息指纹技术与语义分析技术，还能提供多种形式的检测报告,各类高校使用最多。高职院校毕业论文工作与本科院校相比在许多方面有较大的不同，要充分考虑高职院校毕业论文的实际情况。
一、高职院校论文查重工作未能普及的原因
目前对学生论文进行查重检测的高职院校并不多，许多学校对专科生论文进行论文查重的必要性和可行性持观望态度，主要原因有以下三点：（1 )专科学生科研能力较弱，学生论文水平有限，有无检测的意义;（2 )专科论文查重比例如何设定，设定高了就失去了检测的意义,设定低了目标是否能达到。如果学生为了满足查重率而乱改论文，反而会大大降低论文的质量，适得其反；（3 )使用检测系统是否会提高学生论文写作水平。这些原因导致论文查重在高职院校并不普及。
二、高职院校毕业论文的困境
1.实践性不强
2 0 0 4年4月8日教育部颁发《教育部办公厅关于加强普通高等学校毕业设计（论文）工作的通知》,专门对高职学生的毕业设计（论文）提出要求：高职高专学生的毕业设计（论文）要与所学专业及岗位需求紧密结合，可以采取岗前实践和毕业综合训练等形式，由学校教师与企业的专业技术人员共同指导，结合企业的生产实际选题，确定训练内容和任务要求。对高职高专学生要加强毕业设计环节的规范管理，加强过程监控，严格考核，采取评阅、答辩、实际操作等形式，检查和验收毕业设计成果。当前高职院校毕业论文选题过分偏重理论性而忽略实践性，由于缺乏实践作为有力支撑，论文缺乏个人观点，针对性不强，“假”“大”“空”现象严重。
2.部分学生写作能力较低、态度不够端正
高职院校学生高考录取分数较低，一些同学专业理论知识较薄弱，缺乏科研和论文写作能力的训练，在毕业前较短时间内很难独立完成毕业论文。部分同学写作态度不够端正，认为前面所有课程都过关了，学校为了下一年的招生和各种影响,在最后的毕业论文环节不会为难学生，毕业论文和答辩只是形式，走个流程，最终会通过。写作论文就直接到网上搜索相关主题，东拼西凑，结构混乱，从原本应有的精心构思变成了快速制作。
3.论文写作时间与毕业实习时间冲突
高职院校的毕业论文写作时间与顶岗（毕业）实习基本安排在同一学期，毕业论文的写作在实习期间完成，目的是岗位与专业相结合,在岗位中提高专业水平。但实际上许多课题与学生实际实习的岗位不符，学生真正受益不多。在就业形势严峻的情势下，学生往往将重点放在（找）工作上，在毕业论文方面投人的时间和精力较少，严重影响教师的指导、学生写作。
三、论文检测系统的主要作用
对毕业论文进行重合率检测目前被多数高校所采用，因为检测系统主要有以下作用:首先,通过查重可以比较容易地发现抄袭情况,如果抄袭严重，学校可以不允许该论文答辩。由此表明学校对学术不端行为的打击决心,使学生放弃烧幸心理，端正写作态度，逐渐营造出一种公正、公平的学术氛围。其次,以前指导教师评阅学生论文，主要依靠教师自身的知识水平，如果感觉文章存在抄袭，需要自己查阅各种资料加以验证，费时费力，但通过检测系统，很快就能形成一份详细的检测报告，指导教师在此基础上再进行针对性的评阅，大大提高了工作效率。